Сепаратизм в России — явление, вызванное стремлением некоторых этнических, субэтнических и региональных групп, живущих в пределах заявленных границ Российской Федерации, к суверенитету или автономии.

После распада СССР в 1990-х годах, Российская Федерация, по мнению многих политологов, сама находилась на грани распада. В то время на территории России существовало де-факто независимое государство — Чеченская Республика Ичкерия, которое вело боевые действия против федеральных войск в 1994―1996 годах и 1999 ― начале 2000-х годов. Отчасти такая политика была спровоцирована заявлением главы Верховного Совета РСФСР Бориса Ельцина, которое он высказал на встрече с общественностью в Уфе 6 августа 1990 года: «берите столько суверенитета, сколько сможете проглотить». 8 августа он повторил схожие слова в Казани.

Главными центрами сепаратизма в России по состоянию на 1999 год являлись Чечня и Дагестан. По некоторым данным, сепаратистские настроения присутствуют в Ингушетии, Туве, Татарстане, Башкортостане, Якутии и Бурятии. Существует в России и сепаратизм некоторых областей, населённых преимущественно русскими, например, в Калининградской и Кемеровской областях. Однако в последние годы тенденции сепаратизма проявились и в преимущественно русских регионах России уже без этнической окраски. Всего в России выделяют от 31 до 75 точек этно-территориальных напряжений.